芈病毒

来源: 2021-01-13 13:25:46 [] [博客] [旧帖] [给我悄悄话] 本文已被阅读: 次 (8070 bytes)

  自从看了电视剧《芈月传》才认识这个芈(mǐ)字。

  今天说的芈病毒,还是从新冠病毒说起吧。

新冠病毒

  2019年12月29日周日晚上,武汉市金银潭医院(武汉市传染病医院)收治到九位病人。12月30日周一上午,张定宇院长决定‘先进行支气管内镜检查,之后再做肺泡灌洗’。下午4点,完成了7位病人的肺泡灌洗,样本被分成四份,一份送武汉市疾控中心,一份送中科院武汉病毒所,另两份自留。其中一份寄给了上海市公共卫生临床中心张永振团队。

  1月3日周五下午1点半张永振团队收到的病毒样本。36小时后,1月5日周日凌晨两点,张永振团队获得新冠病毒的全基因组序列。当日,他们向上海市卫健委和国家卫健委等主管部门报告,提醒新病毒与SARS同源。后将数据上传到美国国家生物技术信息中心(NCBI)网站上。1月11日上午9时,张永振团队的合作伙伴澳大利亚悉尼大学的爱德华·霍姆斯(福尔摩斯)(Edward Holmes)将此信息发布到 virological.org 网站上。至此,“地球人就都知道了”。

  从美国 NCBI 网站上可以看到,该新冠病毒“Wuhan-Hu-1完整基因序列” MN908947 是1月5日上传的,1月14日升级到第二版,1月17日升级到第三版。该序列后被定为 SARS-2 的基因参考序列 NC_045512.2。

研究病毒

  张永振,1965年生人,博士,教授。他于1982-1986年就读于石河子大学获学士学位,1992-1995年就读于华南农业大学获硕士学位,1995-1998年就读于中国科学院昆明动物研究所获博士学位;1998-2000年在中国预防医学科学院流行病学微生物学研究所从事博士后研究;2001-2020年9月在中国疾病预防控制中心传染病预防控制所从事传染病的预防控制及病毒生物学研究。2020年10月起全职在上海市公共卫生临床中心从事传染病与病毒学研究。复旦大学生物医学研究院与公共卫生学院兼职教授。

  张曾带领研究团队在浙江、湖北和新疆陆地地区以及黄海、东海和南海海洋地区调查研究了节肢动物门(Arthropoda):昆虫、虾、蜘蛛、蝎子蜈蚣等;环节动物门(Annelida):蚯蚓、蚂蟥、沙蚕等;星虫动物门(Sipuncula),软体动物(Mollusca):蜗牛、河蚌、海螺、乌贼等;线虫动物门(Nematoda),扁形动物门(Platyhelminthes),刺胞动物门(Cndaria):水母;棘皮动物门(Echinodermata):海胆、海参、海星等;脊索动物门(Courdata)中的被囊动物亚门(Tunicata):海鞘等动物体内的病毒。

  张永振团队在世界上率先发现了 2000 余种新病毒,张的实验室是世界上发现全新病毒最多的实验室。新发现的病毒、病毒、病毒、病毒等在分类上处于重要位置,荆门病毒是世界首个被发现的将基因组分节段与不分节段两类病毒建立起遗传进化关联的病毒;病毒不但是世界上已知基因组最复杂多样的负链RNA病毒,而且也是世界上发现的第一个具有环状基因组以及能将基因组分节段与不分节段负链RNA病毒建立遗传关联的病毒。全新发现的病毒不但填补了病毒进化上的空白,而且展现了RNA病毒进化上的连续性与漫长的进化历史,系统揭示了RNA病毒遗传进化规律,重新界定了RNA病毒圈。另外,部分新发现的病毒已被证明能引起人类疾病,如温州病毒、荆门病毒等。

  2016年11月30日《自然》杂志上发表了张永振团队的论文《无脊椎动物RNA病毒圈的重新界定》。

给病毒起名

  大家都知道,动物、植物和病毒有个分类法,从顶到底分别是:域(Realm)> 界(Kingdom)> 门(Phylum)> 纲(Class)> 目(Order)> 科(Family)> 属(Genus)> 种(Species)。

  下面举些例子看看发现者给新发现的病毒起了些什么名字。

  负核糖病毒门(Negarnaviricota)的

    单荆病毒纲(Monjiviricetes)> 荆楚病毒目(Jingchuvirales)> 病毒科(Chuvindae)> 病毒属(Mivirus),其中已经发现30个不同种的病毒,例如:Changping mivirusHubei mivirusLishi mivirusSanxia mivirusShayang mivirusTaiyuan mivirusWenling mivirusWuhan mivirusXinzhou mivirus 等病毒种。

    春秋病毒纲(Chunqiuvircetes)> 病毒目(Muvirales)> 病毒科(Qinviridae)> 病毒属(Yingvirus),其中有8个不同的病毒种:Beihai yingvirusCharybdis yingvirusHubei yingvirusSanxia yingvirusShahe yingvirusWenzhou yingvirusWuhan yingvirusXinzhou yingvirus

    允常病毒纲(Yunchangviricetes)> 勾践病毒目(Goujianvirales)> 越病毒科(Yueviridae)> 於越病毒属(Yuyuevirus),有两个种:Beihai yuyuevirusShahe yuyuevirus

  通常,发现者给病毒起名时可以用首次发现的地名,如上面的温州赢病毒、北海於越病毒等。1977年7月在日本北海道札幌市一家育幼院的胃肠炎暴发中发现了一种通过口腔/粪便接触传播的单链正义RNA病毒(其天然宿主是人和猪),于是就并命名为札幌病毒属(Sapovirus)了。

  但有时用地名命名病毒会引起很大争议。也可以换个命名方式,如上面用朝代及相关人物命名,只是不知道用芈姓命名病毒会不会引起那四千名芈姓人的不满。

爱德华·霍姆斯

  爱德华·霍姆斯是张永振的合作伙伴。

  爱德华·霍姆斯(Edward Holmes)1965年出生在英国。1986年获得伦敦大学学院的学士学位。1990年获剑桥大学的博士学位。1990年至2004年先后在加大戴维斯分校、英国爱丁堡大学、牛津大学做博士后研究等。2005年-2012年在宾夕法尼亚大学做教授。

  霍姆斯是一位病毒学家和进化生物学家,自2012年起成为澳大利亚国家健康和医学研究理事会会员,并担任悉尼大学教授。他的研究方向和张永振一样都是 RNA 病毒。

  霍姆斯还是复旦大学的名誉客座教授,是中国疾病预防控制中心的客座教授(2014年起)。他与张永振有长期的合作。在他的个人简历中列出了从2014年-2017年21篇有他和张永振共同署名的文章。在复旦大学生命科学学院网站的教师名录中,有介绍张永振的网页,其中从2018年-2020年6篇文章有他们共同署名。二人合作最早的论文是 2013年的一篇“蝙蝠,食虫和啮齿动物携带汉坦病毒的系统发育和起源”。

所有跟帖: 

牛人 -吃与活- 给 吃与活 发送悄悄话 吃与活 的博客首页 吃与活 的个人群组 (59 bytes) () 01/13/2021 postreply 13:54:18

起个名也要非常慎重哈。谢谢留言 -赌城看客- 给 赌城看客 发送悄悄话 赌城看客 的博客首页 赌城看客 的个人群组 (0 bytes) () 01/13/2021 postreply 14:29:35

谢谢 欲千北 青松站 的鼓励 -赌城看客- 给 赌城看客 发送悄悄话 赌城看客 的博客首页 赌城看客 的个人群组 (0 bytes) () 01/13/2021 postreply 18:40:52

正在边看帖边听轻音乐多谢楼主一贯的诚与谦,坛中多鼓励大家一起渡难关、……谢谢楼主,祝府上,坛里各位健康平安, -青松站- 给 青松站 发送悄悄话 青松站 的博客首页 青松站 的个人群组 (91 bytes) () 01/13/2021 postreply 18:56:59

说的非常非常好。同祝,谢谢! -赌城看客- 给 赌城看客 发送悄悄话 赌城看客 的博客首页 赌城看客 的个人群组 (0 bytes) () 01/13/2021 postreply 19:15:13

谢谢 伶牙俐齿 的鼓励 -赌城看客- 给 赌城看客 发送悄悄话 赌城看客 的博客首页 赌城看客 的个人群组 (0 bytes) () 01/15/2021 postreply 10:04:40

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