美国带头把庚子赔款的一部分退还给中国，主要以办学清华和修建协和医院的方式，培养

培养中国的大学生和医学生。此举后来带动了其他几个国家的效法。各国纷纷在中国建立医院和医学院，教会大学和教会医院。只有日本拿出来的庚子赔款最少，只资助部分中国的留日学生。日本把得到的大部分庚子赔款用到了侵华战争的准备上。孙中山为了取得日本对他推翻满清政府的财务支持，与伊藤博文秘密协定出让部分东北权益，即使如此，日本并未真正支持孙中山的革命。孙中山转而求助列宁，最后导致在苏联的支持下，孙中山建立黄埔军校和赠送中山舰，以及第一次国共合作。

庚子赔款被各国转为培养中国留学生和中国国内的教育资金，部分被各国在中国的教会使用，部分被蔡元培（教育部长）用来栽培中国的大学生。所以在中国有许多教会大学和教会大学培养的中国大学生。第一次大战爆发后的1917年，由于中国参加了协约国，拒绝了继续向德国赔偿后续的庚子赔款。对于其他协约国，庚子赔款继续到1938年。实际培款达到了白银六亿五千二百三十七万余两。清朝的这笔高达全国人民每人一两白银的赔款共计四亿五千万两，部分转化为中国的新一代大学生和西医的出现。