做胃镜时常常会取一小块胃组织(活检)，送病理检查，看看有没有炎症等病变。

病理科会做特殊染色看有无幽门杆菌(Helicobacter pylori)感染。silver stain 是检查H.pylori的一种方法。幽门杆菌是引起胃炎，胃溃疡的主要原因之一。如果阳性，可抗菌治疗。灭了菌，由其引起的胃炎，胃溃疡自然也会很快康复。