假设你说的本民族只是指维族好了：哪怕唐朝以前不算，从唐朝时维吾尔迁到新疆起，他们同化了当地原住民，分别取代了原先的小国，算是统治阶级，但西域那片大地在历史上从来都不能真正独立，这些小国不是依附于东边的汉人政权就是西边或北边的其他民族政权。真正成为强大统治权的只有喀喇汗国，建立于晚唐时期，其实是几个民族合治，并不纯是维族，但后来都归为维族。这个王朝是九世纪到十三世纪，范围开始也只是喀什一带，到十一世纪强盛时包括南疆和东疆，从未包括北疆，而且喀喇汗王把自己称为宋皇的兄弟，以大宋为尊，在钱币上把大宋的标志放在喀喇汗国的标志之上。
后来被契丹人灭后，从蒙古人统治起，经过元朝、明朝，西域大地上的统治势力都是蒙古人，维族人的身份是奴隶，有少数被赐予一定地位的代理人。明朝时最有势力的叶尔羌汗国也是蒙古人建立，也是限于南疆，短时间包括东疆，后来由维族代管。维族人的地位是因为帮助清朝对蒙古人种族灭绝才被清皇帝赐予的，有藩王，但服从于满族人的统治。清政府在每个地区都有八旗军营和汉城，包括现在所谓的喀什古城其实相当大的地盘都是满营与汉城。也就是说，清朝时满族政治地位最高。
所以，你说的"那里的统治阶层也基本上是他们本民族的人"是伪命题。到一战后，土耳其建国后，因为《突厥语大辞典》的出现，同时中国国门开放，留学生到土耳其，然后带回了疆独的思潮，但并未被广大维族人认可，因为当时杨增新比较怀柔。从金树仁统治时，为了消减经费，他开始消藩，再加上援助甘肃灾区加重税赋，疆独的势力开始行成，但并不大。到盛世才时期，赋税更重，军阀混战，苏联、英国等又从中挑拨，疆独势力扩大。
十万国军接管新疆后，对疆独的镇压可是比后来王震要严酷多了。你以为国军杀的维族就只算在国军头上？对疆独来说都是吃猪肉的汉族。知道什么是异教徒吗？另外，我接触过的维族对毛泽东是真心地爱戴，因为毛给了他们土地、给了他们地位，把占人口绝大多数的穷人当作阶级兄弟，这种感恩是没当过奴隶的汉族体会不到的。
边防军，既要管外部入侵，又要防内部突围出国境，哪个国家不是这样？
另外，其他少数民族都亲汉，否则他们早被灭了。弱肉强食是真实上演过的历史。
把新疆从省改成自治纯粹就是学苏联，无事生非。虽然叫维吾尔自治区，下面还设蒙古族、哈萨克族等的自治州，所以说新疆是维族人的，太不准确，也不为其他少数民族所接受。
我不了解西藏。
真诚地请凡才子花时间看看我写的这几篇，谢谢：
