新冠S蛋白NTD结构域与抗体增强效应
12月18日来自日本大板大学的科研团队预印版发表了一篇有重要意义的论文，标题可以意译为发现S蛋白中诱异新冠患者抗S蛋白多克隆抗体中增强病毒感染的一个结构位点。原文链接:“An infectivity-enhancing site on the SARS-CoV-2 spike protein is targeted by Covid-19 patient antibodies”
实验设计与结果大体如下：
1. 根据之前发表的新冠患者血清不同IgG抗体分子抗原识别与结合部位的氨基酸序列(V region) 合成了不同的IgG 抗体(即纯的单克隆抗体)。
2. 用一系列实验检测发现大部分合成的单克隆抗体分子与S1亚基的受体ACE2结合部位(RBD)结合并能抑制病毒入侵表达ACE2受体的细胞。
3. 但发现6种IgG抗体分子与S蛋白N-末端的NTD亚基结合，这种结合反而增强了病毒与ACE2受体细胞的结合及病毒入侵。不同患者抗体增强效应抗体与中和抗体的比率有所变化, 有个体差异。
4.通过计算机模拟抗体与抗原蛋白质分子三维结构匹配分析(docking analysis)与实验测定该团队确定了S蛋白NTD亚基上引起这种抗体增強效应的结构位点(epitope) 。
5. 作者检测了48名非新冠感染者发现其中3名体内已带有与S蛋白NTD亚基抗体增强效应结构位点结合的抗体。
作者的结论是1) 抗S蛋白抗体中针对NTD亚基这种抗体增強效应位点的抗体可能是加重新冠患者病情的因素之一。2) 开发新的表达S蛋白的新冠疫苗应考虑去掉NTD亚基中诱导产生抗体增强效应的这一结构位点。这点对于体内已有抗体增强效应抗体的人尤其重要。文摘中原文如下:“These findings suggest that the production of antibodies against SARS-CoV-2 infectivity-enhancing site could be considered as a possible exacerbating factor for COVID-19 and that a spike protein lacking such antibody epitopes may be required for safe vaccine development, especially for individuals with pre-existing enhancing antibodies.”
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