中队
飞行中队是执行皇家空军主要任务的飞机部队。皇家空军中队与英国陆军的军团系统有些相似，因为可以追溯到中队悠久的建队历史和传统，无论现在驻扎在何处，使用哪种类型的飞机。他们都可以因功勋而被授予军旗和战役荣誉。大多数飞行中队由空军中校指挥，以一个操作喷射机的中队为例，大约配置有12架飞机。[19]
现役中队
第1联队所属:[20]
科宁斯比皇家空军基地
第3中队 – (台风战斗机FGR4)
第11中队 – (台风战斗机FGR4)
第12中队 – (台风战斗机FGR4)
第29中队 – (台风战斗机FGR4) “作战换装部队 (OCU)”
不列颠战役纪念飞行中队
利明皇家空军基地
第100中队 – 鹰式教练机T1A
洛西茅夫皇家空军基地
第1中队 – (台风战斗机FGR4)
第2中队/第II(陆军协同)中队 – (台风战斗机FGR4)
第6中队 – (台风战斗机FGR4)
第9中队/第IX(轰炸机)中队 – (台风战斗机Tranche 1/FGR4) [21]
第120中队 – (P-8海神式海上巡逻机MRA1)
第602(格拉斯哥市)中队(皇家辅助空军) – (P-8导引支援)
马咸皇家空军基地
第207中队 – (F-35闪电II战斗机) (OCU)
第617中队 – (F-35闪电II战斗机)
威汀顿皇家空军基地
第5中队/第V((陆军协同)中队 – (雷神哨兵预警机R1)
第8中队 – (哨兵AEW1)
第13中队 – (MQ-9A收割者侦察机)
第14中队 – (比奇超级空中国王R1)
第39中队 – (MQ-9A收割者侦察机)
第51中队 – (RC-135W 空中搜索者)
第51中队 – (情报, 管制, 目标获取和侦察(ISTAR)，作战换装部队)
第2联队所属:
布莱兹诺顿皇家空军基地
第10中队 – (航行者KC2/KC3)
第24中队 – (C-130J超级大力神/空中客车A400M)
第47中队 – (C-130J超级大力神)
第70中队 – (空中客车A400M)
第99中队 – (C-17A全球霸王)
第101中队 – (空中客车A400M)
诺霍特皇家空军基地
第32中队 – BAe 146/阿古斯特维斯特兰AW109直升机
飞行小队
芒特普莱森特皇家空军基地, 第1435飞行小队的驻地，小队为福克兰群岛提供防空服务。
飞行小队是中队的一支分队。飞行中队通常分为两个飞行小队，例如"A"和"B小队"，每个小队在空军少校下指挥。非战斗性的行政勤务中队在基地中亦分为飞行小队，这些小队由一名低级军官指挥，大多是空军上尉。因为它们规模小，所以亦有几个飞行单位组成了飞行小队而不是中队编制去运作。例如，在福克兰群岛芒特普莱森特皇家空军基地的第1435飞行小队，仅仅用四架台风战斗机FGR4维持防空作业。[22]
基地
主条目：英国皇家空军基地列表
由英国皇家空军管辖、使用的军事设施，称作“皇家空军基地”（Royal Air Force station），包含了军用机场、飞行场、新训基地、行政基地、司令部等。目前英国皇家空军规模最大的基地是牛津郡的布莱兹诺顿皇家空军基地。而美国驻欧洲空军在英伦三岛亦与皇家空军共用十余座基地，萨福克郡的雷肯希斯皇家空军基地及米登霍尔皇家空军基地两处设施美军人员最多。英国皇家空军亦部署多个海外基地。
