如果你在美国,我觉得美国大学的课程成绩的评定还是比较系统化的,应该不会出现你说的问题,如果真的出现了,你也可以循规定申诉的。
我想,你可以向系里申诉,如果你确实只是缺了两次课(不管是因为什么,病还是有事),我相信你一定可以找到同修一门课的同学愿意出来为你作证,找美国同学,他们的顾虑会小一些;至于作业就应该更好办了,难道你们交作业不记录么?作业不打分么?你拿出你整个学期的全部作业来,上面还有打分,不就证明一切了么?别告诉我你把作业都扔了,学期还没结束,课程还没完,你应该保留全部作业的,至少是为了期末复习,还是为了订正你最后错误的课程成绩。