就共同祖先而言，Springer 表示：“狗和猫与穿山甲、马、牛、鲸、蝙蝠、鼩鼱和鼹鼠等哺乳动物的关系，比它们与人类的关系更为密切。”而“人类与鼯猴 [飞狐猴]、树鼩、兔、大鼠和小鼠的关系，比与猫和狗的关系更为密切。”
就基因在染色体内的排列方式而言，人类与猫的相似度是人类与狗相似度的两倍。
德克萨斯农工大学（Texas A&M University）的比较基因组学家 William Murphy 在给《Live Science》的一封电子邮件中指出：如果衡量 DNA 编码随时间推移所发生的变化程度，那么人类与猫和狗的亲缘关系大致处于同等水平。
然而，科学家们还会对比 DNA 链在染色体内的组织排列方式。在这一层面上，差异便显现了出来。
Murphy 解释道，在漫长的演化历程中，现代狗的祖先经历了广泛的染色体重排。（此类重排并非狗所独有；它广泛存在于不同的动植物物种之中，尽管科学家们尚未完全弄清为何某些演化谱系的重排速度会快于其他谱系。）相比之下，猫则保留了一种与人类更为接近的基因组组织结构。他说道：“就基因在染色体内的排列方式而言，人类与猫的相似度是人类与狗相似度的两倍。”
Murphy 表示，鉴于 DNA 的组织方式会影响基因的开启与关闭，因此在理解人类基因调控机制方面，猫或许比狗更适合作为研究模型。
这也使得猫成为研究遗传性疾病的有用对象。例如，多囊肾病（Polycystic Kidney Disease）既见于人类，也见于猫；针对猫所研发的治疗方案，或许能为人类疗法的开发提供启示。
猫或许还能为癌症研究提供线索。近期的一项研究发现，猫体内的癌症相关基因，无论是在数量还是种类上，都与人类体内的同类基因表现出惊人的相似性。其中一个显著的案例涉及一种名为 FBXW7 的基因；在所研究的猫科乳腺肿瘤样本中，超过半数都检测到了该基因的突变。在人类中，同一基因的突变与乳腺癌预后较差有关。
话虽如此，犬类也被用作模型来分析人类疾病，包括阿尔茨海默病、特发性癫痫、眼疾和心脏病。
尽管猫在基因调控方面可能与人类有着更多的相似之处，但迄今为止，更多的研究仍集中在犬类身上。这部分原因可能在于：完整的猫基因组序列问世的时间晚于犬基因组；此外也存在某种历史偏见——长期以来，人们一直认为猫在科研环境中配合度较低。
