据纽约时报，方的病因还不知道。“Mr. Fang was 76. The cause of death was not known, his son said in a telephone interview. ”NY Times By MICHAEL WINES Published: April 7, 2012
方励之：亚利桑那山谷热 Arizona valley fever
方励之去世的细节进一步曝光，杜欣欣在7日的《方励之先生印象》一文中说：4月6日清晨，方老师与意大利物理学家卢菲尼在SKYPE上通话。他们都是MARCEL GROSSMANN MEETINGS的组织委员，他们商讨着第十三届会议的组织工作。说到一半，鲁菲尼就听不到方老师的声音了。后来卢菲尼收到方克的电话才知道方老师去世了。
胡平在方励之去世后说：2011年6月份，方先生得了极为罕见的“亚利桑那山谷热”，被送进医院，体重减轻20多磅，病重时不能站立。不过很快就好了。11月份又得了一次大病，心脏，肝和肾都出了问题，被送进濒危病室，但没几天又好了，会诊的6位医生（3洋人，2来自大陆，1来自台湾）无结论，无一致解释。不多久方先生又上课了。
只是这一次，未能再现奇迹。
于是， 亚利桑那山谷热与方励之的死因挂上了钩。什么是亚利桑那山谷热？
2011年10月份，网络有文称：山谷热病例在亚利桑那肆虐流行，亚利桑那大学医学院的加利亚诺博士解释，从7月的大沙尘暴开始，感染山谷热的病例在增加。这种病与流感相似，病人会发烧，归咎原因是感染了孢子，一种来自索诺兰沙漠的真菌孢子。山谷热的医学名称为球孢子菌病。感染者通常导致肺炎。据称，亚利桑那州每年有10万人感染山谷热，大多数得不到治疗或误诊。
下面是方励之本人在2011年8月24日写的一篇文章，对此略作介绍：
亲莅亚利桑那山谷热
──供想来南亚利桑那者参考
方励之
去年（2010），我写了一篇文章（“我的第一次全盘西化”）纪念我的母亲，特别感谢母亲让我有一副70多年不进医院的身体。忘了也要感谢上帝，麻烦了，今年我就被投进了医院。
山谷热
六月开始，我得了Arizona valley fever （亚利桑那山谷热）。此病只在美国西南流行。以Tucson为最。全美唯一的山谷热研究中心就设在亚利桑那大学的医学院。
有人死活不愿来Tucson，就是惧怕山谷热。到Tucson 的旅游者，也可能给被山谷热感染，回家以后发病。
此病由一种菌类引起。此菌原住在美西南深层地下。在牛仔时代，人只在地表活动，人与该菌和平共处数百年，相安无事。工业化开始了，人不断向地下深挖，侵犯了该菌的居住安宁。该菌从深层地下涌出复仇，攻击地面的动物，包括人类，这就是山谷热。
在Tucson 工作的人，大多被山谷热感染过。一般情况只像一次感冒。我来Tucson 二十年，一直未被山谷热感染。自以为，在中国的50多年的“锻炼”，造就了百毒不侵的“金钟罩铁布衫”。义和团精神还是被山谷热菌击败。
我得了最典型的山谷热（大夫语），即出现所有山谷热的症状：左肺被该菌占领一半。有时发冷，在Tucson的炎热天气下，仍会冷得全身发抖。有时发热，高温到102F（39C），再加持续低烧99（37.2）—100（37.8）。严重咳嗽。难于进食，呕吐。体重骤降，有时一天能降两磅，一个多月里，我的体重总共下降28磅（减肥有效）。血压降低，高压会降到80 mmHg，低压40 mmHg。全身无力，严重时不能站立，不能行走，关节处浮肿。全身的皮肤上出现水痘样红斑，大者直径5厘米，小者半厘米，人皮形如鬼皮也。
菌类不怕所有抗生素。对山谷热无特效药。
医药公司无兴趣发展治山谷热的特效药，因为每年患者约有5万，市场太小了，相比其它药，如糖尿病的销路会上千万。山谷热特效药无利可图。山谷热是地方病，联邦当局也不重视。州当局无钱。新药发展可能要投资上千万美元。州当局只给了20万，杯水车薪。
