秘经完全否决了上帝概念，也否决了神的概念，其基本哲学层面就已经突破了宗教带来的迷信色彩。

秘经其实是真正彻底的无神论。而宗教却无法彻底地和“神”划清界限。单单这个因素就表明了秘经在哲理上的高度。佛教在所有宗教中是最偏向无神论的，可惜，普罗大众常常不自觉地崇拜佛像，XX佛，XX菩萨，把他们当神仙看待，在哲学基础上是无法和秘经相比的。如果一个人能够自觉地从宗教大学毕业，上升到秘经层面，就真的毕业了。

人可以从有神出发，最后当你觉悟后，必然发现无神，因为世界就是你自己啊，哪里来神仙？