该协议第4条规定“本协议之所有事项或为实施而采取之措施，均不得认为影响双方具权限之主管机关有关海洋法诸问题之相关立场”。

马英九对于钓鱼岛的主权主张是一贯的，明确的，而且还专门批驳李登辉“钓鱼岛是日本人的”言论。

这个协定可以看成是马英九版本的“主权在我，搁置争议，共同开发”。

这类的外交妥协在新中国的历史上也是比比皆是。只是不究其底，不在其位，不谋其政的老百姓不理解罢了。大陆千万别民主，民粹太可怕。比台湾更可怕。