1969年10月17日,他被押送到开封市内北土街十号“监护”。他的病本非难症,只因治疗不及时,引起多种并发症,特别是中共上级通知——不宜透视、拍片、会诊,不久又将北京来的人员和药品全部撤回。刘少奇在被囚禁期间遭受到非人道的虐待,据目睹者回忆,刘在遭受强烈的精神打击后,精神崩溃,丧失了语言能力,他把手里的一个小塑料瓶子捏成葫芦形。他瘫痪在床,但看守人员仍将大小便失禁并毫无抵抗能力的刘绑在床上,躺在臭气熏天的床上等死。刘少奇终于在当年11月12日凌晨六时病逝,享年71岁。有资料记载:“刘少奇赤裸的身体难以抵御飞行途中的严寒,到了开封感染了急性肺炎,没有人关心他的病。到开封后被当作一截木头似的推进了监狱。”“在监狱地下室,他已停止了呼吸。遗体上裹床白床单,蓬乱的白发有一尺多长,嘴和鼻子都变形了,下颔一片淤血”。
刘少奇逝世后,遗体就地秘密火化,“火化申请单”使用的姓名是“刘卫黄”,职业是“无业”,死因是“烈性传染病患者”。