公元前60年,西汉统一西域,次年设置细雨都护府,自此,新疆正式列入汉朝版图。
从公元327年前凉再高昌设置高昌郡开始,历代中央政府对新疆的治理方式,由军府制逐渐向郡县制过渡。
公元640年,唐朝灭麯氏高昌政权后,在今乌鲁木齐、昌吉、哈密和吐鲁番地区推行县、乡、里制度,先后建立伊、西、庭三州。三州共辖12县,40多个乡。
1251年,蒙哥汗即位后,便设立了别失八里(今吉木萨尔)行尚书省。
清朝统一新疆后,在汉族聚集较为集中的巴里坤、古城(今齐台)、乌鲁木齐,及其以西直至乌苏一带,实行州、县制度。
1884年清朝政府正式在新疆建省,实现了新疆与内地其他省行政制度的完全统一。
新中国建立时把新疆从省改为民族自治区,实在是自找麻烦。