“我们目前正在目睹由2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)引起的主要流行病。2019-nCoV的发展仍然难以捉摸。我们在刺突糖蛋白(S)中发现了4个插入段,这是2019-nCoV所独有的,在其他冠状病毒中不存在。重要的是,所有4个插入片段中的氨基酸残基均与HIV-1 gp120或HIV-1 Gag中的氨基酸残基具有相同性或相似性。有趣的是,尽管插入片段在一级氨基酸序列上是不连续的,但2019-nCoV的3D建模表明它们会聚在一起构成受体结合位点。在2019-nCoV中发现4个独特的插入片段,这些插入片段都与HIV-1关键结构蛋白中的氨基酸残基具有同一性/相似性,在自然界不太可能是偶然的。这项工作提供了关于2019-nCoV的未知见解,并阐明了该病毒的进化和致病性,对诊断该病毒具有重要意义。”
他们给了个插图和表,表中第一行是新病毒、第二行是艾滋病毒的基因片段,还挺像:
这是一段纯理论工作,我很希望看到后续研究。但是文中用了插入(insertions)一词引起了不满,仿佛是人工插入似的。
文章发表不久,就有人评论说:
“所识别的四个氨基酸插入段都很短,并且在许多其他生物的基因组中发现,而不仅仅是HIV。换句话说,这项工作的主要发现完全是高度期待的巧合。”
“所有生物都包含一个DNA密码,该密码具有关于发育、功能和生长的遗传指令-这就是所谓的“基因组”。您可以将每个基因组想象成一本说明书。这些作者所做的是应看一下2019年新型冠状病毒的基因组说明书,并发现了在相关冠状病毒SARS的基因组说明书中找不到的这4组字母。然后,他们将这些字母与HIV基因组书进行了比较,并发现了一些看起来有些相似但又不完全相同的地方。但是,由于这些字母太短,因此经常在许多基因组书中偶然发现它们。”
“在这里注意:我们称这些字母为“插入”,因为它们在一个基因组中,而不是在近亲中 -“插入”并不意味着对人类的干扰或工程改造 - 它是一个进化术语,指的是自然进化突变。”
多伦多大学的 Jason Weir 留言:“我对表中所示的四个2019年-nCoV插入片段进行了比对,并与HIV-1以外的许多其他序列比对。例如,插入片段RSYLTPGDSSSG的BLAST-P结果与GenBank登录号GenBank:QHR63300.1的蝙蝠冠状病毒的Spike糖蛋白具有100%的同一性。因此,它与已知的蝙蝠冠状病毒的距离比与HIV-1的距离更近。同样,其他三个插入片段中的每个与其他非HIV来源也具有100%的氨基酸同一性。因此,该论文极具误导性,因为它没有讨论与非HIV-1相关来源的其他序列比对,其中某些具有比HIV-1更高的身份。该论文的含义是,2019年的nCoV冠状病毒中插入了HIV-1病毒成分,应对此持怀疑态度。”
在 theprepared.com/blog/ 还有一篇专业人士评论这篇印度论文的博客,更详细的说明新病毒不是“人造”的。