这场战乱极大地改变了陕甘两省的人口數量，民族分布。据《中国人口史》统计，戰爭前的咸丰十一年（1861年），甘肃（此时的甘肃包括今宁夏回族自治区和青海省西宁市海东地区）全省人口总数约为1900万人，战后的光绪六年（1880年）人口仅存495.5万人，人口损失约1400万人，损失比例为74.5%[9]。陕西人口在咸丰十一年（1861年）有1394万，从同治元年（1862年）到光绪五年（1879年）的17年间锐减至772余万，人口损失总数高达622万，大约占战前人口总数的44.6%。17年中，因战争原因造成的人口损失约有520.8万，在全部损失人口中所占的比例高达83.7%，而灾荒期间损失的人口不过101.2余万，占全部损失人口的比例仅有16.3%[7]。其中，汉人的损失占了绝大部分。一部分回民随白彦虎逃至俄国，演变为今天的东干族。
語言
東干族在古代使用一种由波斯語詞彙、語法和部分突厥語詞彙融合的波斯語變種語言，稱為「法爾西」（即波斯語），語言詞彙中帶有大量的突厥語（主要是受到中亞的哈薩克語、吉爾吉斯語、維吾爾語的影響）和俄羅斯語（前蘇聯統一使用俄羅斯語作為官方語言）詞彙。後因外界客觀條件限制，法爾西僅限於族內使用，對外用漢語陝西方言、甘肅方言夾雜波斯語詞彙的「東干語」，在清朝時已演變成帶波斯詞彙的漢語陝西方言。遷至中亞後，由於受到俄羅斯語言文化的影響，現在大部分東干人都兼通夾帶大量波斯語和突厥語詞彙的俄羅斯語。但由於1930年後東干文學的創作，東干語作為一種語言被固定下來，成為當前唯一明確書面使用拼音系統的漢語系社群，現時東干語與漢語陝西方言基本互通，差別只有口音問題。
