James D. Watson 在公开场合发表种族主义言论最广为人知的一次是在 2007 年。当时他接受英国《The Sunday Times》采访时说:「我们的社会政策基于一个假设,即(黑人)智力与我们一样——而所有测试都说并非如此」「与黑人员工打交道的人会发现这不是真的」。
此外,他在 2000 年 的一次会议中也作出有关肤色、欲望强度与智力差异的争议性言论,例如将黑皮肤与较强的性欲联系起来。