因為屠殺、飢荒、屍體傳染疫病、逃荒等原因,甘肅戰前於1861年人口為1945.9萬,1880年人口少了1455.5萬(74.5%);陝西戰前於1861年人口為1394萬,1880年人口少了622萬(45%)[7][8](另一說為少了710萬,即48%)[9]。戰後,清廷將回民叛亂者強遷到西部更遠的地方,以免再生事端[10]。