程在1949年10月被任命为当时成立的“中央人民政府人民革命军事委员会”副主席。而这份任命书于1949年5月由其前身中国人民革命军事委员会”(盖章)签署。而楼主的资料不包括这个委员会副主席的排序。没有什么矛盾之处。
“中国人民政府人民革命军事委员会”存在时,不存在单独的中国共产党的最高军事领导机关。这与后来中共中央军委、国防委员会并存,再后来中共中央军委、国家中央军委并存的状况不同。