从指挥领导角度看，抗联全部历史分为三个阶段

1940年2月伯力会议之前：中共代表团领导（中共中央在上海时，自然也是领导）。但王明回国后，王稼祥（半年），任弼时（近两年）不大过问抗联事情。任弼时传，任弼时年谱，没有这期间同抗联有关的记载。

1940年2月 - 1942年7月：任弼时于1940年2月左右回国（同行的有周恩来），中共不再有驻共产国际代表团。抗联暂时接受苏军指挥。

1942年7月之后：从军事组织上编为教导旅。抗联余部的主体，人是中共的人，但行动上特别是军事行动上完全由苏方领导。教导旅里，一直有两个党组织在活动, 中共党组织，苏联共党组织。