STP及各高人指教

老婆2003年1月至5月f-1收入$6200，学校w2上收入1200（扣掉5000）。6月在另一州找到工作，收入19000,opt,12约31日转为h1-b.w2上扣federal税1200多，扣social security and medical 一共1400多。
我f1,2003收入1200。
我想请教：
1 我们可不可以用1040，file jointly？ 我太太12/31才转为h1-b，不符合RA 时间测试。我们只能以NR alien,分开报税？
我按照NR算了一下，要补税800多!--treaty 5000, personal exemption 3050, 没有standard,只能itemize一些。
2 如果是只能以NR报，那老婆去年是不是不应该交social security and medical? opt其间的收入也是不该交social和medical的吧？我听说social security 很难要回来？
恳请STP和其他高人指教, 万谢!