偷东西的贼把东西还给主人，并不能摆脱偷窃的罪名

你的什么web，什么malware，如何链接，不说清楚无法建议你是否有责任。

勒索的信，一般不要理，等到他们正式告你了再找律师。六千块钱的问题他们不值得化功夫立案，赚不到钱

六千元的索赔，一般就是咋呼你一点钱。