代行和代理，称谓不同而已。

比如，民主党有：代表代行，干事长代理，要比付代表权大。。

在公司里，大多是一种待遇，比如表示你比科长还要高，可也不是次长或部长。

也有的是比较大的部门，这时一般会是正式职务，部长〉代行=代理〉次长〉科长。