如果用因公护照申请签证，那绿卡会被认为自动作废吗？请多指教，谢谢！

情况是这样：我的一个朋友海归回国在国内的一家国企工作。他海归前获得了美国和加拿大的绿卡（用因私护照)。回国后因工作需要，经常出差，单位给他办了因公护照。这次，单位要给他办出差去加拿大的签证。他又不想告诉单位他有绿卡。他的个人信息在两本护照上是一致的，只是护照号不同，办的时间不同，一个因公，一个因私。问题是如果签成了，他的加拿大绿卡还保的住吗？如果相同的情况发生在美国，会有什么结果呢？请各位大侠及有经验的人帮忙分析一下！多谢了！！