小白兔快来救救我

小白兔， 麻烦你帮我看看怎么办：
我申请OPT的时候用OPT的EAD申请了一个PART TIME，这个公司每个月根据我完成的工作寄给我支票。后来我找到了工作，公司给我办了H1B, 但我一直没有退出原先的PART TIME， 也就是说我有四个月拿过两份工资。直到最近我才觉得不对，我想问一问，我申请绿卡时会有什么样的麻烦？有办法搞定吗？多谢了。最近都睡不着觉了。