急问小白兔等高手：学校拿到funding但是employer id 不同，影响485吗

我现在在一所高校做assistant professor,刚申请到一个funding,但是学校管理funding的部门是一个与学校有affiliation的一个财务公司，尽管名称还是学校的title,但是employer id 却和我平时的payroll check 上的不同，请问大家，这样算给不同的雇主工作吗？对485有影响吗？我该怎么应对？
说来也真气人，竟有这样的学校，谁还愿意拉funding?
真得很着急，谢谢大家的回答