不是香港永久居民不能申请回乡证

2 香港居民身份证 是不是可以享受所有香港本地居民的福利?

Not too sure, but I think so.
---------------------------很多本地的福利没有的，但是看病可以。

3 香港居民身份证对每年进出香港的次数是不是有限制?

No. But you have to stay at least 183 days a year in HK to maintain your resident status, otherwise you could get troubles next time when you apply to renew your working visa.
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这个我觉得也未必，只要是雇主支持就好，因为出差长期在外，这个不影响visa renewal