商业化的维生素B2有不同的来源，有微生物发酵产生的，还有大多数以石油为原料化学合成的，后者长期服用可能适得其反。

最好的来源是，当然是天然食物中如发酵食品和动物内脏等，以及人体肠道内自身的细菌合成的，后者产生的量大且利用好，甚至还能制造对健康更重要的维生素K2。