文革中， 对文科生，都很不客气。

1961年2月，李佩先生调入中国科学技术大学，担任外语教研室英语教师。

“文化大革命”中，李佩先生受到较大冲击，被隔离审查长达6年多。1968年12月5日，郭永怀先生不幸因公殉职。 [2] 

1970年2月，李佩先生随中国科大南迁至安徽省合肥市。

从1970年到1973年底，她在科大接受隔离审查，监督劳动，不能工作，来往的信件也要被检查，只是没人贴她的大字报。 [4] 

1976年暑假，李佩奉调回北京。

1978年4月，出任新成立的中国科学技术大学研究生院（后改称中国科学院研究生院，即今中国科学院大学前身）外语教研室主任。 [2] 

李佩和郭永怀及女儿在中关村家中

1980年12月，李佩先生正式加入中国共产党。

1984年，李佩先生将自己著书所得的200元稿费全部交作了党费。