香港作為典型的自由港經濟，轉口貿易在經濟活動中扮演了一個重要的角色。香港經濟高度依賴外部的貿易環境，1997年金融危機使香港經濟遭受重創，香港開始思考新一輪的經濟轉型。特別是內地的改革開放和崛起，香港的航運中心地位不斷受到深圳和上海等港口的挑戰，金融中心地位亦受到上海的擠壓，第三次經濟轉型被提上日程。
特區政府為經濟轉型下了一番苦功，於1998年提出以資訊技術為基礎的計劃，希望發展成以科技產業為主導，配合創新科技和創意工業為核心的經濟體。港府確立了未來工業與創新科技發展的計劃，重點發展生物科技、電子科技、環境科技、基礎工業與資訊科技，興建「數碼港」和打造「中醫藥中心」。然而，由於2001年網路股票價格的下跌，嚴重打擊了香港的創新科技計劃。港府對於轉型的困難缺乏足夠的認知，政策出現搖擺，2003年後，港府沒再提出把創新科技作為香港未來的發展方向，但香港經濟轉型的爭議仍然沒有結束。
轉型失敗原因
如果香港經濟未能成功轉型，在不久將來會逐漸喪失其吸引力和競爭力。因此，檢討經濟轉型失敗的原因極為重要。
一、香港科研創新環境不完善，R&D(研究與發展)支出佔GDP的比重、研究機構數量等指標遠遠落後於新加坡、韓國和台灣地區，科研能力較弱、缺乏科技人才，以及創新的氛圍並不濃厚等，成為香港重振競爭力的障礙。
二、經濟轉型不能單靠市場力量推動，港府須進行產業投資，努力建立競爭優勢。政府的技術和資金支持是培育中小企業自主創新能力的重要推力，但這與香港傳統「積極不干預」政策理念相背，面臨很大的阻力。
三、2001年以後，美國經濟衰退引爆了新經濟的泡沫，並殃及香港經濟，使香港發展資訊科技產業的信心遭受打擊。
四、2003年爆發SARS危機進一步重創香港經濟。政府和社會各界的首要目標是解決經濟的短期衰退，此舉依賴傳統支柱產業的復甦，增加香港經濟轉型這長遠目標的難度。
