军事行动的短期目的是抓捕奥萨马·本·拉登及其他阿尔基地组织首领,防止阿尔基地组织进行其他的恐怖攻击,结束阿富汗成为庇护恐怖分子避风港,摧毁恐怖分子的训练营和基础设施,解除毛拉·奥马尔和他的塔利班政权。长期的军事目的是结束恐怖主义,阻止个别国家对恐怖主义的支持和使阿富汗重归国际社会。