长期以来，台海两岸政治对立，民进党陈水扁执政时期两岸关系陷入冰点。
到2008年5月中国国民党重新执政后，马英九政府恢复两岸两会交流，海协会会长陈云林受邀于10月进行第二次江陈会谈。在会场外受到近千人围攻堵住大门，迫使陈云林无法回到旅馆，只能在别处临时下榻。
同年10月，海协会副会长张铭清以厦门大学观光学院教授身分，接受台南艺术大学邀请到台湾参加学术研讨会。10月19日，张铭清抵台第一天，闹事者包围张铭清预定用餐的台南担仔面餐厅，迫使张铭清更改行程。10月20日，民进党小头目王定宇率众聚集在南艺大校门抗议。并录像公之于众。
10月21日，张铭清在返回饭店的途中前往孔庙参观，正要离开时王定宇率领示威者上前包围，高喊台湾独立，结果场面失控，闹事者将张铭清用力推翻在地，王定宇则自背后抓住张铭清两腋向后拖行，造成张铭清的右侧髋与右侧肩部挫伤。陪同张铭清的人员立即将张铭清护送到孔庙外的车辆，登上座车时又遭闹事者挥拳打中后脑。张铭清坐上车后，王定宇以宣传车挡住去路，并跳上车顶猛踹数分钟，造成车顶凹陷。并以双手挡住车子，以拐杖敲击车子的后车窗，双手按住引擎盖，让车子无法离去。直到支援警力到场，强力隔离闹事者，车子才离去。
10月22日，张铭清取消所有行程提前离台。
对此马英九政府视而不见，甚至可能隔岸观火，洋洋自得。
