东突组织被英美等国政府认定为恐怖主义组织，但并不包括世界维吾尔人大会，后者主张和平方式争取独立所以不会被认为是恐怖分子

2007年6月，参加第六次中美执法合作联合联络小组会议的美国联邦调查局副局长托马斯·富恩斯特在北京回答记者提问时表示，联邦调查局的首要任务就是调查恐怖分子的活动，联邦调查局正与中华人民共和国公安部合作，调查“东突”势力在国际恐怖活动中发挥的作用，以及“东突”与“基地”组织的关系。^[103]

巴基斯坦当局在2002年将东伊运加入恐怖组织名单。2003年10月2日，东伊运发起人之一艾山·买合苏木在巴基斯坦、阿富汗边境的一次反恐怖联合行动中被巴基斯坦军队击毙。2010年3月1日，巴基斯坦情报机构和塔利班官员证实，东突组织“突厥斯坦伊斯兰党”头目阿卜杜勒·哈克·阿尔-蒂尔基斯坦尼在巴基斯坦，被美军无人机发射的导弹击中身亡。

英国内政部在2016年7月15日将东突厥斯坦伊斯兰运动加入恐怖组织名单。^[104]