该不该申请这个职位？

我和现任老板关系不好，她年中时给了我不好的鉴定。这段时间稍有些改善，年终评审快到了，心里没有把握她会给我怎么评。按公正说，我这段的努力她应该都看到了，没有理由再评不好，但她很古怪，我也说不好。
我原计划年终评定后，就在内部换个合适的工作，避开她，可现在刚好有个不错的机会，和我的背景很吻合，也和招聘经理谈了，是个越南女人，看样子还不错，是个技术型的人。觉得机会难得，而且觉得和任何一个老板也会比现在的强(也许太极端了)。
现在很矛盾，因为一旦正式申请，老板就会知道(公司内部)， 不知会不会影响我的年终评定，我下周要回国三周，如果等回来再申请，机会也许就错过了。
我的问题是，我很想要这个职位，现在申请的危险是什么？怎么和现在的老板谈？
请有过类似经历的前辈谈谈建议。
谢谢！