龚楚负伤后辗转到上海养伤数月，于一九三一年八月间大体恢复后决定重返苏区。一九三一年九月二十五日龚楚到达福建苏维埃政府所在地长汀，前往拜访中共福建省委书记卢永次。两人谈话，龚楚问起朱毛红军，卢永次答：毛主席和朱总司令，我们很少见到，更少有谈话的机会，不过，一般同志对朱德的印象很好；至于毛泽东嘛——。卢永次沉思了一会才再说：他的资格及他的聪明才智，当然是现在闽赣苏区的唯一领导者，但他的作风过于严厉，所以畏之者多，真正爱之者很少，这是我的见解，你曾和他两人在井冈山共同工作，应当比我对他们的认识更深刻，我们份属老同志，我得多告诉你，在苏区切勿多言，将来你自会明白的。龚楚转而问他红七军到达苏区后的情形，他说：闻七军有改组派，已经整肃了几个干部，详情我亦不明，你回去七军后，自会知道的，不必急急问我。
龚楚在长汀稍事休息数日后，卢永次来通知他：毛泽东，朱德已派你暂时担任十二军三十四师师长，不必到瑞金去了。龚楚原拟回红七军工作的，但朱毛既已决定，只好服从。
十二军军长罗炳辉，军政委谭震林，参谋长林野，三十五师师长张宗逊，三十四师政委黄甦都来与龚楚见面，表示欢迎。次日，龚楚与黄甦到河田走马上任三十四师师长职位。
龚楚在三十四师任上，发生了两件事，其中一件就是红七军总指挥李明瑞被杀。
龚楚初到三十四师时，曾经接到李明瑞和张云逸的信，都表示盼望他早日重回红七军工作。李明瑞信函内有“如兄不回来，七军前途大有问题”之句。张云逸信中则有：“别后情形，屡经惊险；相见非遥，容作长夜之谈。”由这些字里行间，龚楚敏感到七军里面可能酝酿了极不寻常的暗潮。果然不久就听到了李明瑞被杀的消息。
经过多方探问，龚楚了解到红七军初到江西时候，毛泽东曾欲调整七军干部，但为七军所反对，毛便指七军内有改组派的反动组织，要在七军内进行“肃清改组派”的清党运动，起初杀了二十多个干部，其中有两个是高级干部，嗣后情形渐趋严重。总指挥李明瑞眼见情势不好，绞绳就要套到他的头上了，在第三次反围剿胜利后，驻军于云都会昌之间的一个小墟场，李明瑞打算率领特务连逃离苏区。当他集合特务连宣布脱离苏区时候，跟他多年的心腹卫士林某，竟是一个受过训练奉命监视他的特务人员，受连指导员龙腾云的指挥，立即拔枪把他杀死了。
第二件事情发生在十月下旬。某日晚上，师政委黄甦通知龚楚：“现接军政委谭震林的通知，本师有‘社会民主党’分子五十二人，应即捕杀；已由军部派特务人员直接执行。”龚楚不禁大为惊讶。因为即便本师发现有“社会民主党”分子，也应该秘密通知龚楚和政委，缜密侦查，才不至于发生有错误和冤枉。如今竟在直接执行之后，才通知他，如此越权处理，草率行事草菅人命，使得龚楚不寒而栗。
翌日，龚楚亲自到各团巡视，知道已被捕去排长三人，士兵四十九人，已于昨夜由特务人员押到附近山上秘密处决了。这次秘密捕杀事件，使得全师官兵情绪非常低落，每到一处，他们都怔怔的望着龚楚，那种乞怜求援的神情，使得龚楚看了十分难过。
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