20世纪60年代,东西方两大阵营形成对峙状态,而在印尼政治的生活中主要有三种政治势力:总统苏加诺,印尼陆军以及印尼共产党。
总统苏加诺一直站在第三世界反对帝国主义和殖民主义的前列,倡导“新兴力量”的团结合作,发起并领导不结盟运动,还三次访问中国。苏加诺依赖的政治力量是印尼共产党,他曾说:“我是共产党人的朋友,因为共产党人是革命者。”当时的印共是中、苏以外拥有300万党员的大党,群众基础雄厚。苏加诺甚至考虑到去世后,把国家权力移交到共产党的手中。
苏加诺的政治倾向引起了军队内部如陆军参谋长雅尼,和国防长纳苏蒂安等一些亲美高级将领的不满。亲美将领们成立了“将领委员会”,在1965年9月21日的一次会议上还秘密组成新的内阁,策划1965年10月5日建军节时发动推翻总统的政变。
1965年9月30日,时任印尼总统苏加诺的总统卫队营长翁东抢先行动,绑架并杀害了军官阿古斯·维多约约(Agus Wijoyo)的父亲在内的6名右翼军方将领。随后少将苏哈托,发动反共清洗行动,当年10月开始在印尼全国清扫、镇压共产党分子,印尼共产党中华人居多,但许多不是共产党员的华人也受牵连,成为镇压对象。