CoV-2019 是实验室泄露出来的说法没有根据 (zt自赛先生)

评论:CoV-2019 是实验室泄露出来的说法没有根据

 

撰文 | 项焰(美国德克萨斯州立大学圣安东尼奥医学中心教授)

 

石正丽带领的团队最近在《自然》上发表了一篇文章,描述了他们在武汉肺炎病人上发现一种新的冠状病毒(nCoV-2019)的过程和分析。他们从五个病人的体内得到了病毒的全测序,并拿他们和已知的病毒序列进行了比较,发现是一种新的病毒。

 

这个新病毒和一种蝙蝠冠状病毒 RaTG13 在一个短的区域有高序列同源性。RaTG13 是石正丽他们几年前在云南省的蝙蝠中检测到的,但他们在此之前并没有 RaTG13 的活病毒和全序列。于是他们从保存的 RNA 样品里测了 RaTG13 的全序列,发现 RaTG13 和 nCoV-2019 的全基因组序列有 96.2%的同源性,共有近 1100 个碱基的差异。

 

结合其他冠状病毒的假定突变率估计,RaTG13 和 nCoV-2019 这两种病毒可能在 25 到 65 年前有一个共同的祖先。这表明这两种病毒是近亲。相比之下, SARS 病毒和 2019-nCoV 有约80%的全基因组序列同源性,是更远的亲戚。CoV-2019 是一个从来没见过的新病毒,在实验室目前也没有和 CoV-2019 最接近的蝙蝠冠状病毒 RaTG13 的活病毒,说 CoV-2019 是实验室泄露出来的是没有根据的。

 

石正丽团队为什么要研究动物上的病毒呢?因为要有效防止像 SARS一样的新发传染病,就应该研究 SARS 病毒到底从哪来,还有没有别的病毒会从动物上侵染人类。

 

自 2004 年开始,石正丽团队到中国各个省市采集了数千只中华菊头蝠标本,并对其体内病毒进行基因组分析。2013 年,他们在云南省一个洞穴中发现了一群携带有 SARS 样冠状病毒的中华菊头蝠,通过测序及序列比对,他们发现该病毒与 2003 年爆发的 SARS 病毒具有高度同源性。这个结果说明 SARS 病毒极可能起源于蝙蝠。此成果获得了中国国家自然科学奖二等奖。

 

2015 年美国北卡的 Ralph Baric 团队根据石正丽发现的蝙蝠冠状病毒序列,构建了一个活的蝙蝠冠状重组病毒(这就是网上传的 2015 年Nature Medicine 文章),发现它可以感染人细胞,并以此预测蝙蝠冠状病毒可能会进化到侵袭人类,需要密切监控。和 RaTG13 比,这个蝙蝠冠状重组病毒和 nCoV-2019 相差更远,更不可能是造成武汉肺炎的病毒。

 

2018 年,石正丽联合另外两个团队发现,导致2016 年广州仔猪致死性疾病的冠状病毒,与发生疫情猪场附近的蝙蝠洞穴中发现的冠状病毒全基因组序列一致性高达 98.48%,从而认定广州仔猪致死性疾病是来自于蝙蝠的冠状病毒造成的。这些研究找到了新发病毒的源头,对于防范未来的新发传染病很有帮助。

 

参考资料

 

[1] V.D. Menachery, B.L. Yount, Jr., K. Debbink, S. Agnihothram, L.E. Gralinski, J.A. Plante, R.L. Graham, T. Scobey, X.Y. Ge, E.F. Donaldson, S.H. Randell, A. Lanzavecchia, W.A. Marasco, Z.L. Shi and R.S. Baric, A sars-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence, Nature medicine 21 (2015), no. 12, 1508-1513.

 

[2] X.Y. Ge, J.L. Li, X.L. Yang, A.A. Chmura, G. Zhu, J.H. Epstein, J.K. Mazet, B. Hu, W. Zhang, C. Peng, Y.J. Zhang, C.M. Luo, B. Tan, N. Wang, Y. Zhu, G. Crameri, S.Y. Zhang, L.F. Wang, P. Daszak and Z.L. Shi, Isolation and characterization of a bat sars-like coronavirus that uses the ace2 receptor, Nature 503 (2013), no. 7477, 535-538.

 

[3] B. He, Y. Zhang, L. Xu, W. Yang, F. Yang, Y. Feng, L. Xia, J. Zhou, W. Zhen, Y. Feng, H. Guo, H. Zhang and C. Tu, Identification of diverse alphacoronaviruses and genomic characterization of a novel severe acute respiratory syndrome-like coronavirus from bats in china, Journal of virology 88 (2014), no. 12, 7070-7082.

 

[4] D. Paraskevis, E.G. Kostaki, G. Magiorkinis, G. Panayiotakopoulos, G. Sourvinos and S. Tsiodras, Full-genome evolutionary analysis of the novel corona virus (2019-ncov) rejects the hypothesis of emergence as a result of a recent recombination event, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases (2020), 104212.

 

[5] R. Lu, X. Zhao, J. Li, P. Niu, B. Yang, H. Wu, W. Wang, H. Song, B. Huang, N. Zhu, Y. Bi, X. Ma, F. Zhan, L. Wang, T. Hu, H. Zhou, Z. Hu, W. Zhou, L. Zhao, J. Chen, Y. Meng, J. Wang, Y. Lin, J. Yuan, Z. Xie, J. Ma, W.J. Liu, D. Wang, W. Xu, E.C. Holmes, G.F. Gao, G. Wu, W. Chen, W. Shi and W. Tan, Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: Implications for virus origins and receptor binding, Lancet (2020).

 

 

所有跟帖: 

我感兴趣的是文中最后一段 -吃与活- 给 吃与活 发送悄悄话 吃与活 的博客首页 (714 bytes) () 02/05/2020 postreply 15:21:25

Fatal swine acute diarrhoea syndrome caused by an HKU2-related c -吃与活- 给 吃与活 发送悄悄话 吃与活 的博客首页 (26444 bytes) () 02/05/2020 postreply 15:29:13

请教个:自然界存在的病毒有不同种类,冠状病毒是其中之一。 -pickshell- 给 pickshell 发送悄悄话 (263 bytes) () 02/05/2020 postreply 16:35:47

见内 -吃与活- 给 吃与活 发送悄悄话 吃与活 的博客首页 (622 bytes) () 02/05/2020 postreply 17:43:37

谢谢,我觉得产生这些突变需多长时间这个真难说。。 -pickshell- 给 pickshell 发送悄悄话 (380 bytes) () 02/05/2020 postreply 19:02:35

关键是这些蝙蝠远在云南,浙江,广东,却出现在武汉,是谁把蝙蝠带到武汉的? -5678910- 给 5678910 发送悄悄话 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 15:26:32

多种可能 -吃与活- 给 吃与活 发送悄悄话 吃与活 的博客首页 (541 bytes) () 02/05/2020 postreply 17:51:17

那为啥他们洞里抓蝙蝠的时候没有全副武装隔离呢? -nowayitsover- 给 nowayitsover 发送悄悄话 (106 bytes) () 02/05/2020 postreply 15:48:58

倒不一定是生物武器,我倒是认为她最终是要得到SARS的疫苗。 -cindy2006- 给 cindy2006 发送悄悄话 cindy2006 的博客首页 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 16:08:32

对, 不是生物武器, 是生物武器级别。 -nowayitsover- 给 nowayitsover 发送悄悄话 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 16:20:24

这个环节比较容易出问题 -吃与活- 给 吃与活 发送悄悄话 吃与活 的博客首页 (83 bytes) () 02/05/2020 postreply 17:54:58

她在演讲里专门讲了这个问题 -greennew- 给 greennew 发送悄悄话 (125 bytes) () 02/05/2020 postreply 18:56:35

这篇像是给石教授写的成绩列表,根本没详细解释为什么 -cindy2006- 给 cindy2006 发送悄悄话 cindy2006 的博客首页 (468 bytes) () 02/05/2020 postreply 16:06:58

RaTG13与2019新病毒一致性96.1% -吃与活- 给 吃与活 发送悄悄话 吃与活 的博客首页 (149 bytes) () 02/05/2020 postreply 17:49:42

知道SARS是野生动物吃出来的又咋样?不是照吃吗? -Michelangelo- 给 Michelangelo 发送悄悄话 Michelangelo 的博客首页 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 16:15:13

同样不相信是吃出来的。 如果吃出来的应该是边远地区最先出现病例。 -nowayitsover- 给 nowayitsover 发送悄悄话 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 16:22:21

嗯,提供了更多信息 -杨别青- 给 杨别青 发送悄悄话 杨别青 的博客首页 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 16:17:26

我相信武汉2019新病毒不是他们泄露出来的 -吃与活- 给 吃与活 发送悄悄话 吃与活 的博客首页 (128 bytes) () 02/05/2020 postreply 17:59:47

现在没有证据就应该无罪推定 -杨别青- 给 杨别青 发送悄悄话 杨别青 的博客首页 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 18:15:51

多数研究都是先有个假说,然后再证实或证伪。 -吃与活- 给 吃与活 发送悄悄话 吃与活 的博客首页 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 18:18:42

我的观点是,现在没有证据表明实验室相关,有一定数量的专家怀疑相关才会启动调查 -杨别青- 给 杨别青 发送悄悄话 杨别青 的博客首页 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 18:48:46

这件事也许要多年以后才能有结论,也许永远没有结论。 -吃与活- 给 吃与活 发送悄悄话 吃与活 的博客首页 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 19:03:39

+ -欲千北- 给 欲千北 发送悄悄话 欲千北 的博客首页 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 19:32:07

老百姓缺乏知情权的地方,这种事能有什么结论 -虎嗅蔷薇- 给 虎嗅蔷薇 发送悄悄话 (0 bytes) () 02/06/2020 postreply 05:38:45

怎么证实他们没有活病毒?从冠状病毒的RNA package 冠状病毒技术上很难吗? -秋高气爽92- 给 秋高气爽92 发送悄悄话 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 18:58:47

这只说明15年人造病毒不是CoV-2019, 如何得到‘CoV-2019不是实验室泄露出来’的结论? -哼哈二将- 给 哼哈二将 发送悄悄话 (0 bytes) () 02/05/2020 postreply 20:01:41

看看这个证据,学过遗传分子生物学的应该都知道有没有可信度 -ephd- 给 ephd 发送悄悄话 ephd 的博客首页 (320 bytes) () 02/06/2020 postreply 06:55:30

他那篇文章似有问题:把载体上的外源蛋白序列错当初载体本身。 -吃与活- 给 吃与活 发送悄悄话 吃与活 的博客首页 (557 bytes) () 02/06/2020 postreply 07:10:05

武汉那边往gene bank里提交了病毒的测序结果,复核一下应该没有那么难 -ephd- 给 ephd 发送悄悄话 ephd 的博客首页 (0 bytes) () 02/06/2020 postreply 07:13:40

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