关于商族的起源，一直是历史学界热衷于讨论的话题，在此不一一细说各派的理论，基本四面八方都被论述过了。
商的始祖契被封于商丘的说法就不可信，三皇五帝的传说里掺杂了太多春秋战国时期的社会背景，尤其是儒家，他们不理解上古时期的社会环境，却喜欢以他们崇拜的西周的模式来编织故事，所以在儒家的典籍里出现了上古时期的分封、继承、赐姓之类的行为，这些都是荒诞不实的，却被当作史料记载下来。
商族的史料原本就单薄，并且单薄的史料还是不可靠的，依此来探究问题，必然不会有一个准确的结果。我们在此只选取被篡改的可能性最小的《诗经》、《楚辞》和《山海经》来简单分析一下。
商的始祖叫契，《史记·殷本纪》说他是简狄吞玄鸟卵而生。
《楚辞·天问》有：“简狄在台，喾何宜？玄鸟致诒，如何喜？”
《诗经·商颂·长发》又有：“有娀方将，帝立子生商。”
《诗经·商颂·玄鸟》又有：“天命玄鸟，降而生商，宅殷土芒芒。”
《楚辞·天问》中的“喾”即是帝喾，是商人祭祀的天帝，玄鸟通常被认为是燕子，通过以上的记载，我们大致可以捋清故事的脉络，就是玄鸟奉天帝之命，降卵于有娀氏的女子简狄，而简狄食用该卵之后有孕，生了商族的始祖契。
用神话来解释就是，契是天帝之子，是遵照天帝的旨意而降生于世；用社会学来解释就是契是有娀氏的男子，生于只知其母不知其父的母系氏族社会晚期，而契的出现实现了该部族从母系氏族向父系氏族的转变。
现在的问题是，有娀氏来自哪里？“戎”字从甲戈，表意是擅长战斗，“娀”和“戎”通，所以“有娀”有时候也被写为“有戎”，那么“娀”就可以理解为一个以女子为主的擅长战斗的部族，娀到戎，可以理解为该部族过渡到以男子为主后，部族名字中的“女”字也就不重要了。
有戎与西戎并无关系，东夷、南蛮、西戎、北狄这类说法是春秋战国时期才出现的，这是华夏中心论的副产物，更像是一种理论模型，并没有太大的实际意义，反倒容易混淆不同部族的起源和发展，例如西戎的范围就很宽，有周以来，西北地区更叠过几十个部族和政权，史籍上有记载的带戎的部族就有好几个，如犬戎、狄戎、豲（huan）戎等，而且其部族来源非常复杂，血统不一。但有一点是确定的，就是中原部族通常不会用夷、蛮、戎、狄这类字来命名自己以及自己的祖先。
关于有娀氏的传说，历史上始终是一个空白，无论是甲骨文还是金文都没有关于她的记载，更像是一个突然出现的部族，但从其部族始祖简狄的名字大致可推测，该部族可能活跃于北方的丛林地带，因为在上古时期，携带猎犬狩猎的人才会被称之为狄。
商族有自己独有的谱系，祖先可以追溯到契，神是喾，所以有“殷人禘喾而郊冥，祖契而宗汤”。契、冥和汤是一个脉络下来的，都是这个部族历史上有影响力的人物，契已经说过了，是有娀氏的简狄吞玄鸟卵而生，汤就是伐夏桀的那个商汤，商王朝的建立者，那么冥又是谁呢？
先秦文献里对冥的记载很少，只是说他是一个治水而死的部族首领，“冥”字的本意是一个人在阴暗的地方得不到日月的照射，我们无从得知冥这个人遭遇了什么，但他对商族很重要，所以在商族的祭祀活动中，他处于一个比较重要的位置，相对来说，关于他的儿子的记载要丰富一些，也许能找到一些蛛丝马迹，这个人叫王亥。
王是祭祀的时候追加的，而他的名字应该叫亥，能被追认为王而祭祀，也说明他很重要，《山海经》里有一段关于他的记载。
《山海经·大荒东经》有：“有人曰王亥，两手操鸟，方食其头。王亥托于有易、河伯。仆牛，有易杀王亥，取仆牛。河念有易，有易潜出，为国于兽，方食之，名曰摇民。”
其实山海经记载的是半个故事，有开头有结尾，却没有中间详情，这也是《山海经》的一贯作风，所以《山海经》中的很多记载在没有其它史料相对照的情况下很难读懂。前面的一句应该是对画面的解读，因为《山海经》是按《山海图》而作，是以图示意，“两手操鸟，方食其头”就是画面内容，从后文的故事可推断，图中之人未必是王亥，寓意被食头的应该是王亥而不是鸟。两手操鸟是说明王亥的身份，其所在部族应该是以鸟为图腾的，并以其图腾来寓意其人。
大致意思是王亥与有易氏、河伯有交情，彼此贸易，后来因为一些事情，有易氏杀死了王亥，并扣留了王亥的牛，后来王亥的儿子上甲微攻灭了有易氏，有易氏的一部分人在河伯的帮助下逃了出来，在另外一个地方建国，被称之为“摇民”。
从《大荒东经》到鸟图腾，以及部族的起源传说，基本可以推断出商的始祖出自东夷部族，但就像我们之前说的，东夷所涵盖的范围太大了，南至长江下游，北至辽东，皆被称之为东夷，甚至其文明源起都是不同的，而以鸟为图腾的部族主要集中在山东地区至辽东地区。
而黄河下游地区的东夷源于少皞氏，己姓，是以凤鸟为图腾，而商族是子姓，以玄鸟为图腾，两者虽然有相似处，却也有明显的区别，而玄鸟的传说普遍出现在辽东地区。
东夷的后裔国，如莱国、郯国等并无商族的巫文化，事实上，商族的巫文化是不同于巴蜀的巫文化的另一种文化存在，甲骨卜辞记录了商族仪式、诗、乐、舞四位一体的艺术存在，相信万物有灵，所以商族的祭祀宽泛，不只是神和祖先，风雨雷电，江河湖海，奇珍异兽，可谓包罗万象，并且重牺牲，而且以人祭为主，其恐怖程度可谓是中国历史之最，其实这可以看作是远古的巫觋宗教。这种巫觋宗教更趋近于北方的萨满教，而萨满教源于原始的渔猎时代，流行于渔猎民族，而东北地区就是萨满教文化的源头之一。
商朝灭亡之后，商遗民箕子带领其部分族人北迁，这与后世入主中原的东北政权极其相似，此类政权通常会把东北作为他们的退路而保留，如建立燕国的鲜卑慕容氏，会保留龙城（今辽宁朝阳），金国会保留上京会宁府(黑龙江阿城)，辽国的五京有三个在东北区域，满清始终保留盛京沈阳，清亡后定都长春建立伪满洲国，历史总是惊人的相似，我们不排除商族也有这个情况。商人如果在东北地区没有很强的根基，箕子也不会带领族人北迁，更不可能在强敌环伺的地方立足。
事实上，箕子部族北迁之后，先是在今天的辽宁东南部建国的，挨着他们的亲族孤竹国，并且持续了几百年，直到战国后期，燕国向北扩张，箕子部族才被迫进入今天的朝鲜半岛。
所以单从信仰方面来看，商族不同于中原地区的任何部族，而与东北区域的远古民族有着千丝万缕的联系，我们无法据此就认定商族一定源于东北地区，但其文化上受其区域影响的是很大的，甚至有一些红山文化的影子，但红山文化的重心在辽西至蒙古一带，而商族更可能是环渤海的辽东一带，所以说，如果非得把商族归为东夷，那么商族源自东北夷的可能性要远大于东夷。这也符合中原地区遭外族入侵的规律，一条线路是西北，如周，秦，匈奴，突厥；另一条线路就是东北，如鲜卑，契丹，金，满清。
