楼上数字兄建议的网站说得很不错。有点小建议：

相对于其他大都市，南京市区不大，景点也集中。但你这么短的时间，肯定要做一些取舍，根据你自己的兴趣和同行的状况（有没有孩子等）。

如果是我，第一天的行程中可以把雨花台去掉。也许小时候学校活动去太多次了，觉得政治意义居多。～～当然，如果你对近代史感兴趣，可以去。南京还有大屠杀遇难同胞纪念馆，在江东门。

建议去玄武湖看看，烟波飘缈，很不错，而且是如雷贯耳的景点嘛。如果第一天不去雨花台，下午就可以去，然后去总统府、再去夫子庙。第一天晚上建议在夫子庙游秦淮河，这也是你自己原来的计划。网上说的回到湖南路吃饭不顺，而且秦淮河晚上更好看。

鸡鸣寺很不错，幽静，香火旺，远眺景色也不错，可以穿插在第一天或第二天出发去东郊之前（顺路的）。

上面网站说到的东郊一线很详细。灵谷寺的塔要上去，可以远眺山景，很秀美。逛市区可以放在东郊游玩回来后（新街口，大行宫）。

吃饭的地方说得也很好，第二天晚上可以照办。第二天晚上饭后可以去1912（总统府附近），类似上海的新天地。房子满有特色的，喜欢酒吧就进去坐坐，被宰宰～～不然就逛逛喝点饮料也可。

现在没有人说要去看南京长江大桥了，基本过气了，呵呵。不过如果傍晚有时间可以让车子绕一下，不去也行啊，现在壮观的桥太多了。