阎颜之争:大部分人都忽视了这个事实

来源: 横山杠的白眼王子 2022-11-10 05:30:48 [] [博客] [旧帖] [给我悄悄话] 本文已被阅读: 次 (1654 bytes)

这个事实就是:单从蛋白质结晶体X光衍射数据解析出来的蛋白质3维结构是静态模型,无法推导出动态的功能机制。

阎润涛文章(Cell,1993;PNAS,1995,92:5973)描述了他们用氨基酸点突变进行半胱氨酸扫描实验的结果,发现TM7片段中260-282位置的氨基酸在喇叭口“开”与“关”的过程中起重要作用。

 

 

颜宁的Nature文章(Nature 2014,510:121)主体有六个部分:

  1. Structure determination of GLUT1
  2. Implications for ligand binding
  3. Mapping of disease-related mutations
  4. Critical role of the ICH domain
  5. The extracellular gate
  6. Discussion

1是颜宁实验室用蛋白质结晶体X光衍射数据解析出的蛋白质3维结构描述

2-5都是在用这个3维结构解释已发表文章中GLUT1蛋白的各种氨基酸突变带来的功能变化。文章中提到TM7片段里Tyr 292, Ser 294 and Thr 295的作用,但是并没有讨论阎的文章中260-282位置氨基酸的作用

6 在1-5基础上总结出一个动态模型

颜文章模型的关键在于TM7片段的“开”与“合”。没有引用阎的文章,如何能够推断出TM7片段在喇叭口的作用?这在逻辑上是非常不合理的。

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