很多人不了解密宗，以为本尊就是一个可以保佑我们的神，或是佛。其实本尊是对本来面目的物化，是一种帮助我们修行的假设施。

在密宗的修行次第中，有根本上师，根本本尊，根本护法的设施，这里有很重要的一点，这些都不是我们应该崇拜的对象。这只是在不同的修行阶段中，帮助我们不断超越的次第和方便而已。

为了预防修行者把本尊神秘化或者是异化为不同于自己的真理或是终极境界，在密宗的修行中，专门提出了自成本尊的修行方法。这就是为了打破我们对内与外的分别，和我与非我的分别。