小颜神秘的生化实验
文章来源: SwiperTheFox2019-07-14 05:11:07

小颜2014一文提出模型的published biochemical data 被认为是指的是阎润涛的生化实验, 而不引用。  经仔细研读,我发现其实这句话也许稍有歧义, 应该读成: 

On the basis of our structure analysis and our published biochemical data, we propose a working for GLUT1 (Fig 5.)

也就是说小颜用的是自己发表的, 具体说是2012年做XylE时做的生化实验。 本文给吃瓜群众图解这些生化实验的原理,结果与意义。

一。 颜宁模型里的有关生化实验的部分。 小颜2012年一文里的生化实验不少,为简单起见, 在这里仅举一个突出的例子。小颜对模型的贡献特别突出的一点就是下面这个ICH的重要地位。  小颜用生化实验证明了这个功能团的在细胞里的糖转运里的重要作用。

二。 实验原理: 这个实验原理非常简单。 吃瓜的都该看得懂:

实验的目的是看各种原生和突变的蛋白是否还能转运葡萄糖。 见下图:蓝点是没有标记的葡萄糖,红点是用放射性标记的葡萄糖。 实验就看最后细胞里有多少放射性标记的葡萄糖。 如果正常的就是说该突变对功能影响不大,这个位点不重要; 如果少了,说明突变的位点重要。 

三。 实验数据:ICH的生化实验数据在图5C 。

四: 小颜做了两种生化实验。

吃瓜吃得仔细的群众也许能注意到上图每个数据点有两个柱子。 一个蓝色,一个绿色。

蓝色的是活蛋白实验; 绿色的是用人工合成的脂质体。 

两种实验各有各的好处: 活蛋白实验测量该蛋白在复杂生理条件下的作用,更真实,但因条件复杂,不能排除某些细胞里其他因素的影响。 而人工合成的脂质体简单, 就那一个蛋白,证明就是这个蛋白的作用,但是不能证明这是生理条件下的作用。 两者都做,起到了互补的作用,做到“严丝合缝”

小颜这个图加上2012年图2图4一共做了26个突变, 每个突变做了活细胞与脂质体两种实验,而阎润涛PNAS里做了28个突变, 其中21个用于 everted vesicles 和10个用于活蛋白的进一步的实验。 也就是说小颜2012年一文里光生化实验就跟阎润涛一文差不多, 更别说晶体实验了。

五 实验的结论:

该实验证明,ICH 有一半的突变都对转运功能非常重要,也证明了ICH 本身的重要性。 后来晶体实验suggest这个功能团起到的是门闩的作用, 对这类转运蛋白的机理探究推进了一大进步。。

六。 总结:

小颜的published biochemical data指的是她自己2012年一文里的实验。  阎润涛说小颜只有死的晶体没有活蛋白实验是不正确的。  “指而不引”也是不对的。