You have to have your job title changed

第一点，你的job title：Graduate Developer，是个trainee position。Home Office 是不会给低级职位work permit 的。你的拒绝信里说得很明白，Home Office期待一个senior position。

第二点，你公司说你的工作是NVQ3 equivelant， 并没有提供资料说你的master degree。（NVQ 是低级技术员水平）

我的感觉是你公司不实心给你办permit，或者是完全不懂work permit requirements。

找个律师咨询，把你的文字材料改改，问题应该不大，你和你公司需要专业指导。 ChinaTown有很多这样的dodgy solicitors。

Best of luck